Fiche de DAVID Laurent

Titre : Development of deep-learning approaches to discover metabolic interaction networks of environmental microbial communities from large metagenomic datasets, domain co-occurrence and protein coevolution
Date : 13 décembre 2021
Heure: 14:00
Résumé : L’analyse des séquences biologiques est un des principaux domaines de recherche en bioinformatique. En particulier, la prédiction des interactions protéine-protéine est une étape importante dans la construction des réseaux de protéines sous-jacents, et joue un rôle clé dans la compréhension des environnements moléculaires et cellulaires. Les données brutes produites par le séquençage de nouvelle génération consistent en des lectures obtenues à partir de fragments extraits d’un échantillon métagénomique. Le premier défi consiste à assembler ces lectures, soit par alignement à des séquences de référence, soit par leur assemblage. Cet assemblage/alignement est généralement suivi par une annotation fonctionnelle des régions codantes prédites pour décrire les activités métaboliq
Lieu : Sorbonne Université Institut de Biologie Paris Seine Bâtiment C, auditorium C7 7-9 Quai Saint Bernard 75005 Paris