Informations professionnelles
Statut: Docteur ED
ED: EDITE
Unité de recherche: LIPADE
Employeur: Sorbonne Université Date de debut de thèse: 1 octobre 2018 Date soutenance de thèse: 15 décembre 2021 Directeur de thèse: Hervé ISAMBERT (PC_Curie) Sujet de thèse: Biological network reconstruction from a combination of perturbative and non-perturbative data
Employeur: Sorbonne Université Date de debut de thèse: 1 octobre 2018 Date soutenance de thèse: 15 décembre 2021 Directeur de thèse: Hervé ISAMBERT (PC_Curie) Sujet de thèse: Biological network reconstruction from a combination of perturbative and non-perturbative data
Soutenance de thèse
Données générales
Titre : Interpretable biological network reconstruction from observational data
Date : 15 décembre 2021
Heure: 10:00
Résumé : Dans cette thèse, nous nous concentrons sur les méthodes de reconstruction de réseaux causaux à partir de données purement observationnelles. La thèse peut être divisée en trois parties.
La première partie concerne la modification des méthodes d’apprentissage de structures causales, dite méthodes basées sur des contraintes, en imposant l’interprétabilité du graphe final reconstruit.
La deuxième partie concerne la modification de la méthode MIIC développée par notre équipe. Dans la première section, nous proposons et mettons en œuvre une modification simple, appelée MIIC conservatrice pour des ensembles de données finis. Dans les sections suivantes, nous nous concentrons sur l’amélioration de l’interprétabilité et de l’extensibilité de la méthode MIIC, et proposons la nouvelle méthode iMIIC.
Dans la troisième partie, nous discutons de l’application de iMIIC à la reconstruction d’un réseau clinique à partir des dossiers médicaux de près de 400,000 patients de la base de données SEER.
Lieu : l'amphithéâtre Moissan, Chimie ParisTech
Rapporteurs/ Rapporteuses
Personne | Qualité | Etablissement |
---|---|---|
M. Paulevé Loïc | Chargé de recherche (HDR) | Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique |
M. Benferhat Salem | Professeur des universités | Centre de Recherche en Informatique de Lens, Univ. d'Artois |
Composition du jury
Personne | Qualité | Etablissement |
---|---|---|
M. Isambert Hervé | Directeur de recherche (HDR) | LABORATOIRE PHYSICO-CHIMIE CURIE, Sorbonne Université, CNRS |
M. Paulevé Loïc | Chargé de recherche (HDR) | Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique |
M. Benferhat Salem | Professeur des universités | Centre de Recherche en Informatique de Lens, Univ. d'Artois |
Mme. Rémy Elisabeth | Directrice de recherche | Institut de Mathématiques de Marseille, Univ. d'Aix-Marseilles |
M. Chambaz Antoine | Professeur des universités | Mathématiques Appliquées Paris 5 |