Informations professionnelles
Statut: Docteur ED
ED: EDITE
Unité de recherche: IMPMC (EDITE)
Employeur: Sorbonne Université Date de debut de thèse: 11 octobre 2019 Date soutenance de thèse: 4 octobre 2022 Directrice de thèse: Slavica JONIC (IMPMC (EDITE)) Directrice de thèse: Amélie LEFORESTIER (Laboratoire de Physique des Solides) Sujet de thèse: Image analysis methods development for in vitro and in situ cryo-electron tomography studies of conformational variability of biomolecular complexes: Case of nucleosome structural and dynamics studies Thématique : Images et vision
Employeur: Sorbonne Université Date de debut de thèse: 11 octobre 2019 Date soutenance de thèse: 4 octobre 2022 Directrice de thèse: Slavica JONIC (IMPMC (EDITE)) Directrice de thèse: Amélie LEFORESTIER (Laboratoire de Physique des Solides) Sujet de thèse: Image analysis methods development for in vitro and in situ cryo-electron tomography studies of conformational variability of biomolecular complexes: Case of nucleosome structural and dynamics studies Thématique : Images et vision
Soutenance de thèse
Données générales
Titre : Image analysis methods development for in vitro and in situ cryo-electron tomography studies of conformational variability of biomolecular complexes: Case of nucleosome structural and dynamics studies
Date : 4 octobre 2022
Heure: 14:00
Résumé : In this thesis, two image analysis methods were developed for cryo-electron tomography studies of conformational variability of biomolecular complexes. Each method has a different mathematical model; however, both methods reveal accurate trajectories of macromolecular motion. These methods complement, rather than replace, each other since each of them has strengths and limitations. We have used these methods in a case study of nucleosome structure and dynamics in cells. They have shown coherent results, in line with manual inspection and anticipated nucleosome conformations.
Lieu : IMPMC
Rapporteurs/ Rapporteuses
| Personne | Qualité | Etablissement |
|---|---|---|
| M. Trouvé Alain | Professeur des universités | Centre Borelli (EDMH), Univ. Paris Saclay |
| M. Schultz Patrick | Directeur de recherche (HDR) | Institut de génétique et de biologie moléc, Univ. de Strasbourg |
Composition du jury
| Personne | Qualité | Etablissement |
|---|---|---|
| M. Trouvé Alain | Professeur des universités | Centre Borelli (EDMH), Univ. Paris Saclay |
| M. Schultz Patrick | Directeur de recherche (HDR) | Institut de génétique et de biologie moléc, Univ. de Strasbourg |
| M. Förster Friedrich | Professeur des universités | Université d'Utrecht (Pays-Bas) |
| M. Kervrann Charles | Directeur de recherche (HDR) | Inria Rennes, INRIA |
| M. Volkmann Niels | Directeur de recherche | Biologie Moléculaire Structurale et Processus Infectieux, Institut Pasteur |
| Mme. Leforestier Amélie | Directrice de recherche (HDR) | Laboratoire de Physique des Solides, Univ. Paris Saclay, CNRS |
| Mme. Jonic Slavica | Directrice de recherche (HDR) | Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie, Sorbonne Université, CNRS |