Fiche de KESENCI Yekta

Informations professionnelles


Statut: Docteur ED
ED: EDITE
Unité de recherche: Institut Pasteur (UMR3691)
Employeur: Institut Pasteur


Date de debut de thèse: 1 juin 2020
Date soutenance de thèse: 20 décembre 2023
Directeur de thèse: Jean-Christophe OLIVO-MARIN (Analyse d'images biologiques)
Encadrant : Aleix BOQUET-PUJADAS (LIB)
Sujet de thèse: Analysis and modelling of the dynamics of pathogen-host interactions through force microscopy and image-based mechanobiology


Soutenance de thèse

Données générales

Titre : Characterization of nuclear mechanics with physical models in fluorescence image microscopy
Date : 20 décembre 2023
Heure: 10:00
Résumé : Nous proposons un ensemble de méthodes d’imagerie computationnelle pour calculer les champs de déplacement, de déformation, de contrainte, de forces de traction au bord et de module de Young d’un noyau cellulaire sous imagerie par fluorescence. Chacune obéit à une stratégie en deux étapes, énoncée comme la solution à un problème de mécanique des milieux continus sous faible contrainte quasistatique. La première étape consiste à calculer grâce à une nouvelle méthode variationnelle de flux optique le champ de déplacement du matériel nucléaire à partir d’images de sa déformation. Ces déplacements sont traités lors de la deuxième étape pour en obtenir le demeurant des champs physiques. Nous appliquons notamment ces méthodes à l'étude des dynamiques mécaniques des noyaux glioblastomes et de Toxoplasma gondii.
Lieu : Institut Pasteur

Rapporteurs/ Rapporteuses

Personne Qualité Etablissement
Mme. Muñoz barrutia Arrate Professeure des universités Escuela Politécnica Superior, Universidad Autónoma de Madrid (Espagne)
M. Ladoux Benoit Directeur de recherche (HDR) Institut Jacques MONOD

Composition du jury

Personne Qualité Etablissement
M. Tinevez Jean-yves Ingénieur de recherche Décision et processus Bayesiens, Institut Pasteur
M. Béreziat Dominique Maître de Conférences (HDR) LIP6, Sorbonne Université
Mme. Muñoz barrutia Arrate Professeure des universités Escuela Politécnica Superior, Universidad Autónoma de Madrid (Espagne)
M. Ladoux Benoit Directeur de recherche (HDR) Institut Jacques MONOD
M. Olivo-marin Jean-christophe Directeur de recherche (HDR) Analyse d'images biologiques, Institut Pasteur
M. Boquet-pujadas Aleix MD-PhD laboratoire d'imagerie biomédicale, EPFL