Informations professionnelles
Statut: Docteur ED
ED: EDITE
Unité de recherche: IMPMC (EDITE)
Employeur: CNRS Date de debut de thèse: 1 octobre 2020 Date soutenance de thèse: 4 octobre 2023 Directrice de thèse: Slavica JONIC (IMPMC (EDITE)) Directrice de thèse: Isabelle ROUILLER (University of Melbourne,) Sujet de thèse: Molecular dynamics simulation based image analysis methods for structural studies of biological macromolecular complexes
Employeur: CNRS Date de debut de thèse: 1 octobre 2020 Date soutenance de thèse: 4 octobre 2023 Directrice de thèse: Slavica JONIC (IMPMC (EDITE)) Directrice de thèse: Isabelle ROUILLER (University of Melbourne,) Sujet de thèse: Molecular dynamics simulation based image analysis methods for structural studies of biological macromolecular complexes
Soutenance de thèse
Données générales
Titre : Molecular dynamics simulation-based image analysis methods for structural studies of biological macromolecular complexes
Date : 4 octobre 2023
Heure: 10:00
Résumé : Cryo-electron microscopy allows studying the conformational variability of biomolecular complexes, a key for understanding their function. During my PhD thesis, I investigated new image processing methods based on molecular dynamics simulations that allow extracting continuous conformational variability from cryo-EM data. The developed methods, MDSPACE and MDTOMO, are the first methods using MD simulation that estimate the conformational variability in single particle cryo-EM and cryo-electron tomography and were employed to investigate the conformational behavior of diverse systems such as the ATPase p97.
Lieu : IMPMC - 4 place Jussieu 75005 Paris
Rapporteurs/ Rapporteuses
| Personne | Qualité | Etablissement |
|---|---|---|
| M. Mechulam Yves | Directeur de recherche (HDR) | Biologie structurale de la cellule, Ecole polytechnique |
| M. Schroeder Gunnar | Professeur des universités | Université de Düsseldorf (Allemagne) |
Composition du jury
| Personne | Qualité | Etablissement |
|---|---|---|
| M. Mechulam Yves | Directeur de recherche (HDR) | Biologie structurale de la cellule, Ecole polytechnique |
| M. Schroeder Gunnar | Professeur des universités | Université de Düsseldorf (Allemagne) |
| Mme. Gutsche Irina | Directrice de recherche (HDR) | Institut de Biologie Structurale, Univ. Grenoble Alpes |
| M. Parker Michael | Professeur des universités | Bio21 Molecular Science and Biotechnology Institute, Université de Melbourne (Australie) |
| Mme. Rouiller Isabelle | Maîtresse de Conférences (HDR) | University of Melbourne, (Australie) |
| Mme. Jonic Slavica | Directrice de recherche (HDR) | Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie, Sorbonne Université, CNRS |
| M. Perahia David | Emérite (HDR) | Laboratoire de biologie et pharmacologie appliquée, ENS Paris Saclay |
| M. Weigt Martin | Professeur des universités | Laboratory of Computational and Quantitative Biology, Sorbonne Université |