Description
Date depot: 1 janvier 1900
Titre: Analyse quantitative de coupes histologiques acquises par microscopie virtuelle
Directrice de thèse:
Frédérique FROUIN (LITO)
Domaine scientifique: Sciences et technologies de l'information et de la communication
Thématique CNRS : Non defini
Resumé:
La compréhension des mécanismes impliqués dans les maladies neurodégénératives ainsi que le développement de nouvelles approches thérapeutiques reposent sur l’utilisation de modèles expérimentaux pertinents et de techniques d’imagerie adaptées. Dans ce contexte, la microscopie virtuelle offre la possibilité unique d’analyser ces modèles à l’échelle cellulaire avec une très grande variété de marquages histologiques. La quantité d’information ainsi accessible est très importante et peut atteindre plusieurs centaines de gigaoctets. De ce fait, l’analyse peut devenir extrêmement complexe à réaliser ce qui se traduit, en pratique, par une exploitation partielle de ces données. L’objectif de ce travail de thèse sera de développer des méthodes d’analyse d’image en couleurs permettant de segmenter des objets à l’échelle cellulaire (neurone, microglie, plaques amyloïdes, etc.) pour permettre de quantifier les paramètres morphologiques d’intérêt (taille, densité, localisation, complexité) tant physiologiques que physiopathologiques. De plus, des stratégies d’intégration multi-échelles seront développées pour permettre de mener ces explorations
biologiques de l’échelle cellulaire à l’échelle du cerveau entier (reconstruction 3D, analyse statistique de très grands volumes de données).
Doctorant.e: You Zhenzhen