Description
Date depot: 1 janvier 1900
Titre: Une architecture d'agent-particule pour la modélisation de dynamiques biologiques: application à des dynamiques tumorales et intestines
Directeur de thèse:
Christophe CAMBIER (UMMISCO)
Domaine scientifique: Sciences et technologies de l'information et de la communication
Thématique CNRS : Non defini
Resumé:
L’objectif de notre thèse est de contribuer d’un point de vue informatique par une approche qui permet de décrire des dynamiques spatialisées de cellules biologiques. Dans ces dynamiques spatialisées, il est à noter un aspect physique important relatif au mode de transport des cellules biologiques dans leur environnement. Ce mode de transport s’effectue par convection/diffusion [REF] qui sont deux phénomènes de transport naturels très présents dans les milieux physiques, écologiques et en particulier biologiques. Dès lors, disposer d’une approche qui intègre et décrit bien ces phénomènes de convection-diffusion permettra de modéliser de façon précise et réaliste le comportement des cellules, leurs interactions réciproques entre elles et avec leur environnent, ce qui est difficilement faisable avec les méthodes équationnelles ou à base d’agents.
C’est ainsi que nous proposons une approche basée sur la méthode numérique SPH (Smoothed Particle Hydrodynamics) qui modélise le système cellulaire en un groupe d’entités élémentaires ou particules lagrangiennes situées. La méthode de modélisation avec SPH a montré de nombreux avantages surtout quand le système à étudier est de nature discrète et présente des dynamiques spatialisées de diffusion comme dans ce cas-ci. Cette approche sera appliquée sur deux problèmes dans le cas de maladies d’origine cellulaire. Le premier cas est la croissance d’une tumeur cancéreuse et le deuxième est relatif aux instabilités de la flore microbienne intestine suite à des perturbations extérieures (antibiotiques par exemple) pouvant favoriser l’obésité ou le cancer du colon.
Doctorant.e: Ka Cheikhou Oumar