Informations professionnelles
Statut: Docteur ED
ED: EDITE
Unité de recherche: LIPADE
Employeur: China Scholarship Council Date de debut de thèse: 17 novembre 2019 Date soutenance de thèse: 3 novembre 2023 Directeur de thèse: Nicolas LOMENIE (LIPADE) Directeur de thèse: Julien CALDERARO (APHP (UP)) Encadrant : Christophe KLEIN (CRC) Sujet de thèse: Intelligent Exploration of Whole Slide Image for Digital Pathology Thématique : Intelligence artificielle
Employeur: China Scholarship Council Date de debut de thèse: 17 novembre 2019 Date soutenance de thèse: 3 novembre 2023 Directeur de thèse: Nicolas LOMENIE (LIPADE) Directeur de thèse: Julien CALDERARO (APHP (UP)) Encadrant : Christophe KLEIN (CRC) Sujet de thèse: Intelligent Exploration of Whole Slide Image for Digital Pathology Thématique : Intelligence artificielle
Soutenance de thèse
Données générales
Titre : Weakly supervised learning for immune profiling from hepatocellular carcinoma digital slides
Date : 3 novembre 2023
Heure: 09:30
Résumé : Nous étudions les méthodes d'apprentissage profond avec une supervision faible pour prédire les profils immunitaires associés à la réponse au traitement à partir de diapositives numériques. Nous avons d'abord conçu un flux de travail pour classer les patients présentant une surexpression des signatures géniques liées à la sensibilité à l'immunothérapie. Ce flux de travail a été étendu à la prédiction de populations de cellules immunitaires et stromales afin d'étudier leur corrélation avec ces signatures génétiques. Nous avons modifié le flux de travail pour prédire l'expression génique de la signature ABRS, qui permet de prédire la sensibilité à l'atezolizumab (immunothérapie), en combination avec le bevacizumab, l'une des normes de soins pour le CHC avancé, avec un pipeline innovant que nous avons développé pour la validation in situ en utilisant la transcriptomique spatiale. Les méthodes sont prometteuses pour développer des biomarqueurs basés sur l'image pour l'immunothérapie.
Lieu : 45 Rue des Saint Pères, Salle Turing
Rapporteurs/ Rapporteuses
Personne | Qualité | Etablissement |
---|---|---|
M. Mueller Henning | Professeur des universités | MedGIFT, Haute Ecole de Gestion (Suisse) |
M. Di tommaso Luca | Professeur des universités | Université de Milan (Italie) |
Composition du jury
Personne | Qualité | Etablissement |
---|---|---|
Mme. Sokolovska Nataliya | Professeure des universités | Laboratory of Computational and Quantitative Biology, Sorbonne Université |
Mme. Renaud Florence | Maîtresse de Conférences | APHP (UP), INSERM |
M. Mueller Henning | Professeur des universités | MedGIFT, Haute Ecole de Gestion (Suisse) |
M. Di tommaso Luca | Professeur des universités | Université de Milan (Italie) |
M. Lomenie Nicolas | Professeur des universités | Laboratoire d’Informatique Paris Descartes, Univ. de Paris Cité |
M. Calderaro Julien | Professeur des universités | APHP (UP), Univ. Paris-Est Créteil |